Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn11P35235 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn11P35235 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms