Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pou3f3P31361 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pou3f3P31361 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms