Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxc10P31257 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms