Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cd28P31041 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cd28P31041 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cd28P31041 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms