Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VtnP29788 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VtnP29788 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VtnP29788 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VtnP29788 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VtnP29788 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VtnP29788 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VtnP29788 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VtnP29788 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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