Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkcdP28867 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PrkcdP28867 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms