Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprmP28828 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprmP28828 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprmP28828 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprmP28828 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprmP28828 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
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