Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RxraP28700 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RxraP28700 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RxraP28700 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RxraP28700 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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