Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Defa2P28309 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms