Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb1P28230 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms