Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ChgaP26339 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ChgaP26339 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ChgaP26339 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms