Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnna1P26231 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnna1P26231 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms