Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf239P24399 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf239P24399 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms