Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Hoxd8P23463 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
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Hoxd8P23463 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Hoxd8P23463 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxd8P23463 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Hoxd8P23463 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Hoxd8P23463 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxd8P23463 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Hoxd8P23463 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Hoxd8P23463 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Hoxd8P23463 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxd8P23463 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxd8P23463 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxd8P23463 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Hoxd8P23463 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd8P23463 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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