Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkchP23298 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkchP23298 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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