Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PparaP23204 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PparaP23204 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PparaP23204 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PparaP23204 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms