Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SftpcP21841 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SftpcP21841 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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