Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnc2P20801 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnc2P20801 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms