Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a2P20490 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms