Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrkcaP20444 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms