Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ntf3P20181 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ntf3P20181 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms