Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VimP20152 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VimP20152 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VimP20152 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
VimP20152 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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