Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P20040 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P20040 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P20040 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P20040 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P20040 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P20040 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P20040 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P20040 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P20040 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P20040 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P20040 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P20040 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
P20040 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
P20040 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms