Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PdgfaP20033 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PdgfaP20033 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfaP20033 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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