Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rpl13aP19253 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms