Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18528 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18528 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18528 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18528 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18528 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18528 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
P18528 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P18528 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18528 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18528 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18528 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18528 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18528 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18528 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18528 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18528 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18528 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18528 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18528 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18528 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18528 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P18528 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P18528 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P18528 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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