Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtpraP18052 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtpraP18052 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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