Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxb1P17919 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Hoxb1P17919 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Hoxb1P17919 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Hoxb1P17919 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Hoxb1P17919 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Hoxb1P17919 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Hoxb1P17919 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Hoxb1P17919 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Hoxb1P17919 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Hoxb1P17919 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Hoxb1P17919 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxb1P17919 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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