Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Defa-rs1P17533 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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