Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrphP15331 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrphP15331 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrphP15331 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrphP15331 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrphP15331 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PrphP15331 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PrphP15331 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms