Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcp1P11983 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms