Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtcP11725 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtcP11725 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtcP11725 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtcP11725 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtcP11725 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtcP11725 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtcP11725 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtcP11725 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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OtcP11725 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtcP11725 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
OtcP11725 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
OtcP11725 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
OtcP11725 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
OtcP11725 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
OtcP11725 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
OtcP11725 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
OtcP11725 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
OtcP11725 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
OtcP11725 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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