Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd4P10628 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms