Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PolP10400 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PolP10400 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PolP10400 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms