Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Becn2P0DM65 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Becn2P0DM65 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Becn2P0DM65 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Becn2P0DM65 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Becn2P0DM65 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Becn2P0DM65 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Becn2P0DM65 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Becn2P0DM65 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Becn2P0DM65 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Becn2P0DM65 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms