Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb1P09055 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb1P09055 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms