Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01648 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01648 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01648 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01648 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01648 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01648 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01648 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01648 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01648 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01648 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01648 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01648 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01648 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01648 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01648 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01648 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01648 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01648 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01648 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01648 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01648 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P01648 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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