Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01647 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01647 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01647 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01647 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms