Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01644 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01644 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01644 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01644 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01644 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01644 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01644 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms