Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01641 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01641 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01641 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01641 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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