Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a20bO88575 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms