Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CntfrO88507 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CntfrO88507 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms