Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Kcnk4O88454 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Kcnk4O88454 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Kcnk4O88454 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Kcnk4O88454 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Kcnk4O88454 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Kcnk4O88454 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Kcnk4O88454 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Kcnk4O88454 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Kcnk4O88454 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Kcnk4O88454 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnk4O88454 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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