Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm10509O88255 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms