Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srpk1O70551 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srpk1O70551 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srpk1O70551 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srpk1O70551 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srpk1O70551 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srpk1O70551 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srpk1O70551 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Srpk1O70551 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srpk1O70551 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srpk1O70551 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srpk1O70551 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srpk1O70551 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srpk1O70551 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srpk1O70551 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Srpk1O70551 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Srpk1O70551 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms