Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb5O70309 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms