Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Foxq1O70220 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms