Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RngttO55236 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RngttO55236 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RngttO55236 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RngttO55236 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RngttO55236 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RngttO55236 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RngttO55236 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RngttO55236 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RngttO55236 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RngttO55236 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RngttO55236 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RngttO55236 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RngttO55236 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RngttO55236 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RngttO55236 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RngttO55236 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RngttO55236 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms