Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkbO55229 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkbO55229 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChkbO55229 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChkbO55229 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms