Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Copb2O55029 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms